| 项目 | 内容 |
|---|---|
| SOP 编号 | 000001 |
| 名称 | 常规转录组分析 |
| 版本 | v1.0 |
| 适用范围 | Bulk RNA-seq |
| 分析类型 | Paired-end RNA-seq，Gene-level expression analysis |
| 负责人 | 转录组分析负责人 |
| 审核人 | 实验室生物信息学负责人 |
| 最后更新时间 | 2026-09-17 |
建立实验室标准化的 Bulk RNA-seq 常规分析流程，对 RNA-seq 测序数据进行：
原始数据检查 → fastp 数据预处理 → 参考基因组准备 → HISAT2 比对 → BAM 排序 → StringTie 转录本定量/辅助 QC → featureCounts 基因定量 → DESeq2 差异表达分析
最终获得：
本 SOP 主要用于实验室常规 Bulk RNA-seq 数据分析，不包含单细胞 RNA-seq、空间转录组、长读长 RNA-seq 等特殊分析。
每个样品应提供：