<aside> 🧪
Status terbaru — October 6, 2026
Jawaban A1–A3 telah disusun dan diperiksa terhadap sumber. Tiga komposisi tersimpan di Coopetition; upvote FkpA tercatat dan akses forum diverifikasi. Volume dan DNA target pada input diperiksa. Log 27 langkah, sumber keputusan dan tabel komposisi tersedia pada bagian 17/subhalaman. Laporan Inggris telah terbit dan diverifikasi pada website HW3, termasuk tiga JSON dan gambar bukti pengajuan. Hasil eksperimen belum tersedia. Estimasi biaya UI memiliki perbedaan saat reload yang dicatat sebagai batas verifikasi.
</aside>
Pemilik jurnal: Naufal Tsabitul Azmi. Kursus: HTBAA Fall 2026. Target tugas: sfGFP, TfCut2/PETase, dan reteplase. Deadline HW3: October 6, 2026; jam dan zona waktu cutoff perlu dikonfirmasi.
Navigasi: HTGAA 2025 — Catatan Belajar dan Roadmap Naufal · RootGuard HW2 — Jurnal Desain TasA di Kernel (29 Sep 2026) · Pertemuan 7 — Study-Ready: Nebula & Desain Reaksi Cell-Free.
Tujuan resmi HW3 adalah merancang komposisi reaksi cell-free protein synthesis (CFPS) untuk menurunkan biaya produksi protein fungsional. Biaya reaksi rendah saja tidak cukup jika yield atau aktivitas protein ikut jatuh.
| Tahap | Pertanyaan yang dilatih | Hubungan dengan pekerjaan Naufal |
|---|---|---|
| HW1 | Apa produk, pengguna, sistem biologis, dan workflow produksinya? | RootGuard: konsep inokulan mikroba yang didukung biochar untuk jagung dalam keterbatasan air; belum tervalidasi secara biologis. |
| HW2 | Bagaimana merancang instruksi DNA yang dapat dipertanggungjawabkan? | TasA dalam konteks B. subtilis. Gunakan status terkini pada jurnal HW2, bukan snapshot historisnya. |
| HW3 | Bagaimana memilih lingkungan biokimia agar protein dibuat, folding, dan berfungsi secara ekonomis? | Tiga target yang ditentukan kelas dalam kerangka cell-free berbasis lysate E. coli. |
Batas hubungan: HW3 tidak meminta mengganti target dengan TasA atau mengubah proyek RootGuard. Keterampilan desain, dokumentasi, assay, dan optimasi dapat digunakan kembali; konstruksi DNA HW2 tidak otomatis kompatibel dengan ekspresi T7 pada HW3. Protein aktif juga tidak sama dengan bukti fungsi produk di lapangan.
| Tempat | Fungsi | Status awal |
|---|---|---|
| Halaman jurnal ini | Catatan proses, alasan keputusan, revisi, dan bukti | Dibuat sebagai jurnal kerja |
| Instruksi HW3 | Acuan deliverable dan deadline | Teks dibaca; gambar tidak diaudit |
| Coopetition | Membuat dan mempublikasikan komposisi; Community Reagents | Akses akun dan inventory terkini belum diverifikasi |
| Forum cfps-coopetition | Diskusi dan klarifikasi | Akses belum diverifikasi |
| Website homework pribadi | Dokumentasi yang dikumpulkan untuk kelas | URL halaman HW3 belum dicatat; jurnal Notion tidak otomatis menjadi submission di website |
| Spesifikasi coopetition | Batas reaksi, inventory, assay, dan pengajuan plate | Bagian relevan dibaca; dokumen berlabel draft |
Jangan menyimpan password, kode verifikasi, token, atau detail akun privat pada jurnal yang dibagikan melalui tautan. Simpan screenshot yang hanya memperlihatkan informasi tugas.
| Waktu | Kegiatan | Implikasi |
|---|---|---|
| October 6, 2026 | Deadline HW3; lecture Kate Adamala dan review desain awal | Target pengumpulan awal individu |
| October 8, 2026 | Recitation ideasi komposisi global | Kesempatan diskusi dan revisi |
| Pekan mulai October 12, 2026 | Office hours virtual untuk merencanakan 80 komposisi unik | Detail masih TBD; bukan otomatis 80 desain per mahasiswa |
| October 20, 2026 | HTBAA mengajukan permintaan eksperimen resmi ke Ginkgo | Pengajuan tim, bukan pengganti deadline HW3 |
Kandidat bacaan awal yang direkomendasikan tugas: PANOx-SP dari Jewett & Swartz (2004), formulasi biaya rendah Olsen dkk. (2026), dan/atau formulasi AI Smith dkk. (2026). Angka konsentrasi perlu diambil dari metode atau supplementary information, bukan dari abstrak saja.